Offre de formation de la faculté des sciences et technologie de l'UPEC

Détails de l'UE "Génomique et transcriptomique - S9" (5 ECTS)

Code APOGEE	Intitulé	ECTS	CM	TD	TP	1ère Session									2ème Session
						CC			Examen			Dérogatoire			Examen
						Ecrit	Oral	TP	Ecrit	Oral	TP	Ecrit	Oral	TP	Ecrit	Oral	TP
CSYEGTR0	Génomique et transcriptomique	5	29	12	9				70%		30%	70%		30%	70%		30%

Publics concernés

Mention "Sciences et technologie de l'agriculture, de l'alimentation et de l'environnement", parcours "Biologie intégrative (OMICs)", semestre M2-S3

Responsable(s) pédagogique(s)

Lise DUPONT
Idir Ouidja

Pré-requis / co-requis

L3 chimie-biologie ou L3 SVT, ou salariés des entreprises dans le cadre de la formation continue : master complet ou modules qualifiants ou validation des acquis de l'expérience (VAE)

Objectifs

Ce cours aura pour objectif de renforcer les connaissances des étudiants sur la génétique, les différentes méthodes  d'analyse en génomique et transcriptomique et sur l'interprétation des données.  L'objectif est de les former à la conception d'une étude scientifique utilisant ce type d'outils.

Connaissances / compétences acquises

Contenu détaillé de l'enseignement

Le cours se déroulera sous forme de cours magistraux, de TDs avec analyse d'articles scientifiques et d'un TP intégré .
Examen final (70%), compte rendu de TP (30%)

Méthode d'enseignement

cours magistraux, TP intégré et visites de terrain

Evaluation par les étudiants

questionnaire en fin d’UE

Indications bibliographiques

Greg Gibson, Spencer V. Muse (2004).Précis de génomique. De Boeck Supérieur. ISBN-13- 9782804143343
Virginia García-Cañas, Alejandro Cifuentes, Carolina Simó (2014). Applications of Advanced Omics Technologies: From Genes to Metabolites. Elsevier. ISBN: 978-0-444-62650-9
Gubb, Ewa; Matthiesen, Rune (2010). Introduction to omics. Methods in molecular biology, Volume: 593, Pages: 1-23

Liste des UEs

Liste des parcours

Mention	Parcours	M1S1	M1S2	M2S3	M2S4
Mathématiques et interactions	Analyse, probabilité et applications	✔	✔
	Analyse et applications			✔	✔
	Probabilités et statistiques des nouvelles données			✔	✔
	Finance			✔	✔
Informatique	Logiciel	✔	✔	✔	✔
Chimie	Chimie des molécules bioactives	✔	✔	✔	✔
	Polymères fonctionnels	✔	✔	✔	✔
	Physico-chimie moléculaire et applications	✔	✔	✔	✔
	Analyse et assurance qualité	✔	✔	✔	✔
Ingénierie des systèmes complexes	Systèmes distribués et technologies des réseaux	✔	✔	✔	✔
Ingénierie des systèmes complexes	Systèmes cyber-physiques, technologies de l'information, de l'intelligence et du contrôle	✔	✔	✔	✔
Traitement du signal et des images	Instrumentation de la pollution atmosphérique	✔	✔	✔	✔
	Signaux et images en médecine - Sciences de l'ingénieur	✔	✔	✔	✔
	Signaux et images en médecine - Sciences de la vie et de la santé	✔	✔	✔	✔
Optique, image, vision et multimédia	International biométrie	✔	✔	✔	✔
Mécanique	Modélisation et simulation en mécanique des solides	✔	✔	✔	✔
	Modélisation et simulation en mécanique des fluides et transferts thermiques	✔	✔	✔	✔
	Approches multi-échelle pour les matériaux et les structures	✔	✔	✔	✔
Sciences et génie des matériaux	Matériaux avancés et nanomatériaux	✔	✔	✔	✔
Sciences et génie des matériaux	Science des matériaux pour la construction durable	✔	✔	✔	✔
Sciences et technologie de l'agriculture, de l'alimentation et de l'environnement	Ingénierie biologique pour l'environnement	✔	✔	✔	✔
	Analyse des risques sanitaires liés à l'alimentation	✔	✔	✔	✔
	Biologie intégrative (OMICs)	✔	✔	✔	✔
Génie industriel	Maintenance et maîtrise des risques industriels	✔	✔	✔	✔

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