| Code APOGEE | Intitulé | ECTS | CM | TD | TP | 1ère Session | 2ème Session | ||||||||||
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| CC | Examen | Dérogatoire | Examen | ||||||||||||||
| Ecrit | Oral | TP | Ecrit | Oral | TP | Ecrit | Oral | TP | Ecrit | Oral | TP | ||||||
| CSYEAOS0 | Autres omiques et systèmes intégrés | 3 | 18 | 12 | 20% | 20% | 60% | 100% | 100% | ||||||||
Biochimie structurale, biologie moléculaire
Fournir aux étudiants des connaissances théoriques et méthodologiques sur la régulation de l’expression différentielle des gènes et l’influence des facteurs environnementaux sur ces mécanismes. Ces connaissances sont fondamentales car elles révèlent une lecture différente d'un même code génétique, en fonction des tissus et des types cellulaires ainsi que des conditions de l’environnement. Ce code épigénétique varie dans le temps, suite au vieillissement, aux maladies, et aux stimuli environnementaux. Ces variations épigénétiques associées aux pathologies (cancer, maladies neurodégénératives), sont également considérées comme une source de plasticité des organismes en situation de contrainte, notamment chez les végétaux.
- Connaître les principaux mécanismes moléculaires permettant de réguler l’activité épigénétique chez les animaux et les végétaux - Appréhender l’intégration de l’épigénomique en liaison avec les autres omics, à l’échelle du métabolisme (métabolomique) et des interactions moléculaires (interactomique) par l’analyse d’articles scientifiques.
Certains chapitres seront dispensés en pédagogie inversée Le cours comportera une partie concernant l’étude des mécanismes de la régulation épigénétique chez les animaux et chez les plantes : Modifications de l’ADN (méthylation) ; modifications des histones (méthylation ; acétylation) ; rôles des microARN dans la régulation de l’expression des gènes lors du développement et du vieillissement, mais aussi lors de pathologies comme le cancer et les maladies neurodégénératives ; modalités d’expression et rôles des longs ARN non-codants, dans le développement et l’adaptation des organismes à leur environnement. La notion d’ « épimédicament » sera abordée (DNMTi, HDACi). Le cours traitera également les processus épigénétiques spécifiques aux animaux et aux végétaux. Une seconde partie abordera les techniques d’étude des processus épigénétiques (immunoprécipitation de la chromatine ChIP ; séquençage haut-débit associée aux ChIP, entre autres). TD : analyse détaillée d’articles
Cours magistral / séances de TD classiques (analyse détaillée d’articles) Certains chapitres seront dispensés en pédagogie inversée
questionnaire
Epigenetics, a reference manual. JM Craig & NC Wong, Caister Academic Press (2011) Handbook of Epigenetics: The New Molecular and Medical Genetics. Trygve Tollefsbol, Academic Press, Elsevier.(2012)
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